在黑暗组织的阴影下，名侦探柯南（工藤新一）逐渐逼近核心秘密。一次偶然的机会，他发现了组织BOSS的真实身份——竟是早已被认定死亡的富豪乌丸莲耶。更令人震惊的是，组织利用APTX4869药物不仅用于暗杀，还在进行长生不老的实验。柯南与FBI、CIA联手，在最终决战中揭露了组织遍布全球的阴谋。然而，灰原哀的过去、安室透的潜伏、以及赤井秀一的牺牲，让这场斗争充满悲壮。柯南能否在药效消失前破解所有谜题，恢复真实身份？一场智慧与勇气的终极较量就此展开。