本片聚焦灰原哀的过去与现在，她曾是黑衣组织的成员雪莉，逃离后化名灰原哀寄宿在阿笠博士家。神秘列车上，贝尔摩德伪装成灰原哀试图刺杀她，而柯南与赤井秀一联手布下反制陷阱。列车化身生死战场，灰原哀面对组织追杀与内心恐惧，最终在同伴帮助下逆转局势。影片紧凑悬疑，展现了灰原哀的坚强与脆弱，以及她与柯南之间深厚的羁绊。