在《超市特工第三季》中，平凡店员查克·巴托斯基继续身兼双重身份：白天是超市员工，夜晚是CIA秘密特工。本季剧情围绕查克与女友莎拉的感情波折展开，同时他必须面对新反派——前特工肖的致命威胁。肖为复仇不择手段，甚至绑架查克的好友摩根。在伙伴们的帮助下，查克利用“交织”系统与智慧破解阴谋，最终在超市屋顶展开终极对决。本季以情感冲突与高燃动作结合，展现了普通人在极端压力下的成长，完美收尾系列核心悬念。