在圣兽警察成功平息第一波兽化危机后，城市却陷入更深的黑暗。新反派“暗影博士”利用基因改造技术，制造出拥有圣兽基因的超能力罪犯，他们能化身暗影野兽，在城市中制造混乱。圣兽警察队长龙牙发现，这些罪犯体内竟有与圣兽相似的共鸣纹路，暗示着更巨大的阴谋。为了对抗暗影势力，龙牙必须唤醒体内沉睡的远古圣兽之力，却因此面临被兽性吞噬的风险。在搭档飞鸟的帮助下，他经历了一场灵魂与力量的试炼，最终解锁全新圣兽形态——光翼圣兽。决战中，龙牙以光翼之力净化暗影，揭露博士企图用基因病毒控制全球的野心。圣兽警察再次守护了人类与野兽的平衡，但暗影之下，新威胁已在酝酿。